Primärkonsumenten nehmen nicht immer die erste trophische Ebene in einem Nahrungsnetz ein. In den meisten terrestrischen Ökosystemen besteht die Basis aus photosynthetischen Produzenten wie Pflanzen und Algen. Allerdings werden in bestimmten Umgebungen – insbesondere in Ökosystemen tiefseehydrothermaler Quellen – die Primärproduktion durch Chemosynthese und nicht durch Sonnenlicht angetrieben.
In diesen einzigartigen Systemen bilden chemosynthetische Bakterien und Archaeen die Grundlage des Nahrungsnetzes. Primärkonsumenten in diesen Lebensräumen sind Organismen, die sich direkt von diesen Mikroorganismen ernähren. Dies verdeutlicht, dass die trophische Struktur von der verfügbaren Energiequelle abhängt und Primärkonsumenten je nach Ökosystem auf verschiedenen Ebenen existieren können.