Hausfliegen haben viele natürliche Feinde:
Spinnen fangen sie in Netzen. Vögel wie Schwalben und Blauhäher fangen sie im Flug. Eidechsen wie Geckos und Chamäleons fangen sie an Wänden. Frösche und Kröten benutzen klebrige Zungen, um Fliegen zu fangen. Gottesanbeterinnen überfallen sie. Venusfliegenfallen fangen sie mit spezialisierten Blättern. Fliegenfallen benutzen Klebepapier oder Lockstoffe. Pestizide können sie töten, müssen aber vorsichtig verwendet werden, um andere Tiere und Menschen nicht zu schädigen.