Weißkopfseeadler sind opportunistische Prädatoren, die fressen, was verfügbar und leicht zu fangen ist. Ihre Ernährung besteht hauptsächlich aus Fischen, die sie durch Eintauchen ins Wasser fangen. Bevorzugte Fischarten sind Lachs, Forelle, Barsch und Karpfen. Sie jagen auch kleine Säugetiere wie Kaninchen, Eichhörnchen und Präriehunde und fressen gelegentlich Aas. Gelegentlich fressen sie Vögel, Reptilien und Insekten.