Ethnobotanik hat einige Nachteile:
- Unvollständige oder ungenaue Informationen: mündliche Überlieferungen können im Laufe der Zeit verzerrt oder verloren gehen.
- Kulturelle Sensibilität und Ausbeutung: Forschung kann ohne angemessene Zustimmung der Gemeinschaft oder Gewinnbeteiligung stattfinden.
- Eingeschränkter Geltungsbereich: Ergebnisse aus bestimmten Gemeinschaften lassen sich nicht auf andere Regionen verallgemeinern.
- Schutzherausforderungen: unverantwortliche Praktiken können zur Überernte von Pflanzen führen.
- Ethische Überlegungen: Fragen rund um informierte Zustimmung, geistiges Eigentum und Gewinnbeteiligung müssen sorgfältig gehandhabt werden.
Trotz dieser Herausforderungen bleibt Ethnobotanik wertvoll, wenn sie ethisch und respektvoll angegangen wird.