Wüstenkängururatten sind einer Vielzahl von Fressfeinden ausgesetzt, darunter:
Säugetiere
* Kojoten, Bobkatz, Dachse, Füchse: Opportunistische Prädatoren, die Kängururatten fangen können.
* Klapperschlangen: Können Kängururatten überfallen, wenn auch seltener.
Vögel
* Erdhuhn, Uhu, Laufvögel: Luftige Prädatoren, die Kängururatten leicht fangen können.
* Schlangen: Verschiedene Schlangen, wie Nattern und Peitschen-Schlangen, können sie erbeuten.
Anpassungen an die Prädation
Wüstenkängururatten sind nachtaktiv, leben in Baue, haben starke Hinterbeine zum Springen und besitzen ausgezeichnetes Gehör und Geruchssinn, um Fressfeinde zu erkennen. Trotz dieser Anpassungen bleiben sie verwundbar.