Selbst erfahrene Haustierbesitzer finden es schwierig, das Geschlecht eines Bartagamen zu bestimmen. Während männliche und weibliche Bartagamen tendenziell leicht unterschiedliche Erscheinungen haben, gibt es keine universellen offensichtlichen äußeren Unterschiede.
Buckel unter dem Schwanz
Ein ausgewachsener männlicher Bartagame kann zwei parallele Buckel auf der Unterseite seines Schwanzes haben; diese Buckel befinden sich direkt über der „Kloake“ an der Schwanzbasis. Wenn ein Bartagame diese Merkmale aufweist, ist es definitiv männlich. Allerdings zeigen nicht alle männlichen Bartagamen dieses Merkmal.
Größe
Weibliche Bartagamen neigen dazu, etwas kleiner zu sein als Männchen, aber andere Faktoren beeinflussen die Größe der Echse.
Bartfarbe
Weibliche Bartagamen verdunkeln ihren Bart seltener als Männchen. Allerdings werden dunkle Bärte bei beiden Geschlechtern beobachtet.
Schwanzdicke
Erwachsene weibliche Bartagamen neigen dazu, etwas dünnere Schwänze zu haben.
Interne Geschlechtsorgane
Ein qualifizierter Tierarzt oder Herpetologe kann eine Technik namens Proben verwenden, um das Geschlecht eines Bartagamen zu bestimmen. Dieser Prozess stimuliert den Bartagamen, sodass er seine internen Geschlechtsorgane zeigt. Proben kann einen Bartagamen ernsthaft verletzen, daher sollte es nur von einem Experten versucht werden.