Flutbecken haben keine bestimmte Farbe. Sie variieren je nach Tageszeit, Standort und den vorhandenen Organismen. Flutbecken können blau, grün, braun oder rot erscheinen. Tagsüber können sie durch Sonnenlichtreflexion blau oder grün wirken. Bei Sonnenaufgang oder Sonnenuntergang können sie rötlich oder orange erscheinen. Algen und Mikroorganismen beeinflussen die Farbe ebenfalls.