Beifang
Die Hauptbedrohung für den Baiji ist die versehentliche Einfang in Fischernetzen. Der verstärkte Fischfang im Jangtsekiang hat die Wahrscheinlichkeit erhöht, dass Individuen in Geräten gefangen werden, insbesondere aufgrund der reduzierten Population und des begrenzten Verbreitungsgebiets der Art.
Lebensraumverschlechterung
Der Jangtsekiang ist einer der am stärksten verschmutzten Flüsse der Welt. Schadstoffe wie Schwermetalle, Pestizide und Arzneimittel können bei Delfinen Krebs, Fortpflanzungsprobleme und Immunfunktionsstörungen verursachen. Der Staudammbau und andere Wasserprojekte haben ebenfalls zur Lebensraumverschlechterung beigetragen.
Jagd
Obwohl die chinesische Regierung die Jagd auf Baiji-Delfine verboten hat, findet weiterhin illegale Jagd statt. Delfine werden wegen ihres Fleisches gejagt, das in einigen Gebieten als Delikatesse gilt, und wegen des Öls, das in der traditionellen chinesischen Medizin verwendet wird.
Die kumulativen Auswirkungen dieser Bedrohungen verursachten einen schnellen Populationsrückgang. In den 1980er Jahren lebten schätzungsweise 400 Baiji-Delfine im Jangtsekiang. Bis Ende der 2000er Jahre waren nur noch 18 Individuen übrig. Im Jahr 2016 wurde der Baiji als funktional ausgestorben erklärt, ohne bestätigte Sichtungen seit 2002.