Seepferdchen zeigen eine große Vielfalt an Farben und Mustern, die je nach Art und sogar innerhalb derselben Art variieren. Häufige Farben sind:
- Gelb: blasses bis leuchtendes Goldgelb
- Orange: helles Pfirsichorange bis tiefes rötlich-orange
- Rot: helles rötliches bis tiefes intensives Rot
- Braun: helles Beige, Karamell und Schokoladenbraun
- Grün: dezente Grüntöne oder Olivgrün
- Blau: selten, aber einige Arten zeigen blaue oder blaugrüne Schattierungen
- Schwarz: dunkelbraune oder schwärzliche Färbung
Viele Seepferdchen haben auch gepunktete oder gestreifte Muster. Einige Arten können ihre Farbe schnell für Tarnung oder Kommunikation ändern. Spezifische Farben variieren je nach Standort, Lebensraum und individueller Variation.