Eichhörnchen sind in Parks und Wäldern allgegenwärtig. Wie alle Tiere sind sie anfällig für Krankheiten. Virale und bakterielle Erreger in ihrem Lebensraum können Krankheiten auslösen, manchmal mit tödlichem Ausgang. Eichhörnchen in Gefangenschaft genießen möglicherweise den Vorteil tierärztlicher Versorgung, während die in der Wildnis auf sich allein gestellt sind.
Knochenerkrankung (MBD)
Eichhörnchen, die an einer Knochenerkrankung leiden, haben eine schlechte Ernährung, insbesondere einen Vitamin-D-Mangel oder Lichtmangel. MBD kommt häufig bei gefangenen Eichhörnchen vor, die nicht ausreichend natürliches Licht erhalten. Es kann ausgeglichen werden, indem man den Tieren mindestens 20 Minuten direkte Sonneneinstrahlung pro Tag bietet oder, falls nicht möglich, Vollspektrum-Leuchtmittel verwendet. Symptome sind Lethargie und Schmerzen.
Eichhörnchenpocken
Eichhörnchenpocken, auch Eichhörnchenfibrom genannt, verursachen das Wachstum von Tumoren auf der Epidermis des Eichhörnchens. Es wird virulär übertragen, meist durch Mücken oder von Eichhörnchen zu Eichhörnchen. Junge Eichhörnchen sind am anfälligsten. Die Tumoren können zu ernsthafteren Tumoren der inneren Organe metastasieren. Es gibt kein bekanntes Heilmittel gegen Eichhörnchenpocken.
Parasiten
Eichhörnchen sind anfällig für eine Reihe parasitär bedingter Krankheiten. Dazu gehören Baylisascaris (eine Art Spulworm), Hakenwürmer (die Anämie verursachen können), Kokzidiose (eine parasitäre Erkrankung des Dünn- und Dickdarms, die zu inneren Blutungen führt) und Giardia (ein weiterer Darmparasit, der meist durch verunreinigten Kot übertragen wird).
Enzephalomyokarditis
Enzephalomyokarditis ist eine weitere Viruserkrankung. Sie verursacht Entzündungen und Degeneration von Skelett- und Herzgewebe und zerstört das Nervensystem des Eichhörnchens. Die Krankheit wird meist durch Kontakt mit infizierten Nagetieren oder durch sekundäre bakterielle Übertragung verbreitet. Symptome sind erhöhter Puls, Atemprobleme, Blasen, körperliche Schmerzen und ein Mangel an Motorik. Infizierte Eichhörnchen werden bei sekundärer bakterieller Infektion mit Antibiotika behandelt.