Haie
Haie sind die primären Räuber von Fleckenadlerrochen. Arten wie Weißer Hai, Tigerhai, Bullenhai und Zitronenhai jagen sie.
Meeressäuger
Schwertwale und bestimmte Delfine, darunter Großer Tümmler und Rundkopfdelfin, erbeuten ebenfalls Fleckenadlerrochen. Seelöwen, wie Kalifornischer und Steller-Seelöwe, nutzen Geschwindigkeit und Wendigkeit, um sie zu fangen.
Menschlicher Einfluss
Der Mensch ist ein weiterer Hauptfeind, der Fleckenadlerrochen oft für Fleisch, Flossen und Haut fängt.