Weißkopfseeadler-Eier schlüpfen nach etwa 35 Tagen Brutzeit. Zunächst übernimmt das Weibchen den größten Teil des Brütens, während das Männchen Nahrung herbeischafft. Mit der Zeit beteiligt sich das Männchen stärker, und schließlich teilen sich die Eltern die Brutpflichten gleichmäßig, bis die Küken schlüpfen.