Die größte Schwäche des Weißkopfseeadlers liegt im Bruterfolg. Eine Vielzahl von Faktoren kann eine erfolgreiche Fortpflanzung stören, darunter Extremwetterereignisse, Prädation durch andere Tiere, Krankheiten und menschliche Störungen in der Nähe von Nestplätzen.
Umweltverschmutzung spielt ebenfalls eine bedeutende Rolle. Die Exposition gegenüber Schwermetallen, Kunststoffen, Pestiziden und anderen giftigen Chemikalien kann die Gesundheit von Adlern beeinträchtigen und den Bruterfolg reduzieren. Da Weißkopfseeadler nahe der Spitze der Nahrungskette stehen, können sich Schadstoffe im Laufe der Zeit in ihren Körpern anreichern.
Der Schutz von Nisthabitaten und die Verringerung von Umweltkontaminanten bleiben wesentliche Schritte, um die weitere Erholung dieses ikonischen amerikanischen Greifvogels zu gewährleisten.