Die Philippinen beheimaten mehrere gefährdete Reptilien, darunter:
- Philippinen-Krokodil (Crocodylus mindorensis)
- Salzwasserkrokodil (C. porosus)
- Philippinen-Waran (Varanus olivaceus)
- Visayan-Warzenwaran (V. bitatawa)
- Philippinen-Waldschildkröte (Siebenrockiella leytensis)
- Grüne Meeresschildkröte (Chelonia mydas)
- Oliv-Bastardschildkröte (Lepidochelys olivacea)
- Lederschildkröte (Dermochelys coriacea)
- Philippinen-Dachschildkröte (Kachuga mindorensis)