Fleece ist oft eine bessere Wahl als herkömmliche Einstreu, weil es saugfähig, weich, bequem, leicht zu reinigen und wiederverwendbar ist. Allerdings kann es teuer sein, schwerer zu finden sein, und einige Meerschweinchen könnten es anknabbern.
Andere Einstreuoptionen sind Stroh, Papier, Holzspäne und Pellet-Einstreu, jede mit ihren eigenen Vor- und Nachteilen. Stroh und Holzspäne können staubig sein, während Papier rutschig sein kann. Pellet-Einstreu ist saugfähig und staubfrei.