Kurzflossen-Makohaie sind pelagisch und bewohnen offene Ozeangewässer. Sie gelten als einsame Jäger, können aber gelegentlich lockere Ansammlungen oder Gruppen bilden, wenn sie sich von reichlich vorhandener Beute ernähren oder während Wanderungen. Diese Gruppen sind temporär und keine dauerhaften sozialen Strukturen.