Der Ägyptische Flughund ist ein Frugivore, was bedeutet, dass er hauptsächlich Früchte frisst. Heimisch in Afrika und im Nahen Osten, genießt er Datteln, Feigen, Bananen, Guaven, Mangos und Papayas. Neben Früchten konsumiert er manchmal auch Nektar, Pollen und Insekten.
Als fruchtfressende Fledermäuse spielen sie eine wichtige ökologische Rolle bei der Samenverbreitung und Bestäubung in ihrem Verbreitungsgebiet.