Zooplankton ist als Ganzes nicht gefährdet. Es handelt sich um eine vielfältige Gruppe kleiner Wassertiere, die in vielen Lebensräumen vorkommen. Bestimmte Arten können lokal durch Verschmutzung oder Habitatzerstörung zurückgehen, doch dies sind lokale Probleme, die nicht alle Zooplankton-Populationen betreffen.
Zooplankton bildet die Basis mariner Nahrungsnetze und ist entscheidend für den globalen Kohlenstoffkreislauf. Während einzelne Arten empfindlich auf Umweltveränderungen reagieren können, sorgt die enorme Artenvielfalt und weite Verbreitung für die Resilienz der Gruppe insgesamt.