Konkrete Aufzeichnungen über Tiere der Mission San Jose (Mission Santa Clara) sind rar, aber spanische Kaliforniamissionen hielten typischerweise:
Nutztiere
- Rinder für Fleisch, Milch, Häute, Arbeit.
- Schafe für Wolle.
- Pferde für Transport und Arbeit.
- Schweine, Ziegen, Hühner für Fleisch und Eier.
Andere Tiere
- Hunde für Bewachung und Jagd.
- Katzen zur Nagetierkontrolle.
- Esel für Warentransport.
Genauere Tierbestände variierten nach Ressourcen und Bedarf. Ureinwohner nutzten auch einheimische Wildtiere für Nahrung und spirituelle Zwecke.