Baumkängurus haben nicht im traditionellen Sinne einen einzigen „natürlichen Feind“. Ihre baumbewohnende Lebensweise und ihr begrenztes Verbreitungsgebiet machen sie gegenüber vielen Feinden relativ sicher. Dennoch sind sie anfällig für:
Greifvögel: Große Adler und Habichte, wie der Papuaner Adler, stellen eine Bedrohung für junge Baumkängurus und manchmal auch für adulte dar.
Kleine Säugetiere: Obwohl sie keine primären Feinde sind, können einige kleine Säugetiere, wie verwilderte Katzen und Hunde, Baumkängurus jagen, besonders junge.
Menschen: Lebensraumverlust und Jagd sind erhebliche Bedrohungen für Baumkänguru-Populationen.
Es ist erwähnenswert, dass sich Baumkängurus an ihre Umgebung angepasst haben, indem sie starke Krallen und Sprungfähigkeiten entwickelt haben, die ihnen helfen, Feinden zu entkommen. Sie haben auch eine tarnähnliche Färbung, die sie in ihre Umgebung einbettet und sie schwerer zu entdecken macht.