Das Atmungssystem eines Affen ähnelt dem des Menschen und umfasst Nase, Rachen, Kehlkopf, Luftröhre, Bronchien, Bronchiolen, Alveolen, Lungen und Zwerchfell. Luft tritt durch die Nase ein, gelangt die Luftröhre hinunter in die Lungen, und der Gasaustausch findet in den Alveolen statt.
Affen haben im Allgemeinen kleinere Lungenvolumina im Verhältnis zur Körpergröße und eine schnellere Atemfrequenz als Menschen. Ihre Stimmstrukturen ermöglichen eine breitere Palette von Lauten. Anpassungen wie flexible Rippenkäfige unterstützen ihren baumbewohnenden Lebensstil.
Spezifische Details variieren zwischen Affenarten, aber das Grunddesign ist äußerst effizient und anpassungsfähig.