Der Gelbschwanz-Wollaffe ist gefährdet wegen:
- Lebensraumverlust und -fragmentierung: Rodung des Regenwaldes für Holzabbau, Landwirtschaft, Viehzucht und Bergbau.
- Jagd und Wilderei: Wegen Fleisch, Fell, Haustieren und Pflanzenschutz.
- Klimawandel: Schnelle Lebensraumveränderungen, die Nahrung und Unterschlupf beeinträchtigen.