Blaukehlchen sehen sich mehreren Problemen gegenüber: Konkurrenz mit Haussperlingen und anderen Höhlenbrütern um Nistkästen. Sie werden von Schlangen, Katzen und Greifvögeln gejagt, Eier und Nestlinge sind besonders gefährdet. Lebensraumverlust, Pestizide, Klimawandel und Krankheiten wie aviäre Pocken, West-Nil-Virus und Salmonellose bedrohen die Bestände zusätzlich.