Wechseladler fressen hauptsächlich Säugetiere, darunter Affen (Makaken, Languren, Colobus-Affen), Galagos, Buschbabys, Schimpansen, Gorillas, Lemuren. Auch Vögel wie Turakos, Erdhornvögel, Francolins. Kleinere Beute: Baumschliefer, Riesenhörnchen, Gleithörnchen, Ducker, Mangusten. Gelegentlich Reptilien (Schlangen, Eidechsen) und Insekten (Käfer, Heuschrecken, Termiten).