Ornate Adlerrochen sind aufgrund von Überfischung gefährdet, oft als Beifang in Operationen, die auf Thunfisch, Schwertfisch und Haie abzielen. Ihre große Größe und ihr langsames Wachstum machen sie besonders anfällig. Die Zerstörung von Korallenriffen und Mangroven, die Nachfrage nach ihrem Fleisch und ihren Flossen sowie Meeresverschmutzung tragen ebenfalls zu ihrem Rückgang bei.
Schutzbemühungen wie nachhaltige Fischerei, Meeresschutzgebiete, Verschmutzungsreduktion und öffentliche Aufklärung sind notwendig, um sie zu schützen.