Harpyienadler sind kraftvolle Prädatoren, die Faultiere, Affen, große Fledermäuse, Reptilien und Vögel wie Aras erlegen können. Angesichts ihrer Stärke sind sie wahrscheinlich in der Lage, Tukane in ihrem Verbreitungsgebiet zu verzehren, wenn die Vogelgröße nicht prohibitiv ist.