Aye-Ayes können monogam sein und lebenslang paaren, obwohl einige Individuen Polygamie praktizieren. Männchen locken Weibchen durch Duftmarkierung und Lautäußerungen an. Nach einer Tragzeit von etwa 170 Tagen bringt das Weibchen ein einzelnes Jungtier zur Welt. Das Baby wird mit einem vollen Fellkleid und offenen Augen geboren. Die Mutter trägt ihr Junges etwa 14 bis 16 Wochen lang in den Armen, und das Junge säugt sechs bis acht Monate. Aye-Ayes werden mit etwa zwei Jahren geschlechtsreif und können in Gefangenschaft bis zu 25 Jahre alt werden.