Schwarzschwanz-Präriehunde sind hauptsächlich Pflanzenfresser, wobei Gräser und Kräuter den Großteil ihrer Nahrung ausmachen. Gräser werden ganzjährig verzehrt, während blühende Pflanzen (Kräuter) im Frühling und Sommer wichtiger sind.
Sie fressen auch Insekten wie Heuschrecken, Käfer, Ameisen und Motten, besonders im Sommer und Herbst, wenn Insekten reichlich vorhanden sind. Früchte und Samen, einschließlich Beeren, Pflaumen, Kirschen und Sonnenblumenkerne, werden saisonal oder das ganze Jahr über gefressen.
Diese abwechslungsreiche Ernährung liefert die Nährstoffe, die Präriehunde zum Wachsen und Fortpflanzen benötigen, und die Nahrungsverfügbarkeit beeinflusst stark, wo sie leben und wie viele in einem Gebiet überleben.