Präriehunde stehen vor mehreren Bedrohungen, die zu Populationsrückgängen geführt haben:
- Habitatverlust: Kolonien wurden durch Landwirtschaft, urbane Entwicklung und Landnutzungsänderungen reduziert.
- Pestizide: Nagetierbekämpfungschemikalien können Präriehunde vergiften.
- Krankheiten: Waldpest, Tularämie und Staupe können sich durch Kolonien ausbreiten.
- Jagd: In einigen Gebieten wird aus Sport oder zum Schutz von Nutztieren gejagt.
- Prädation: Kojoten, Wölfe, Füchse und Greifvögel jagen Präriehunde.
Mehrere Präriehundarten sind gemäß dem Endangered Species Act als gefährdet oder stark gefährdet gelistet. Schutzbemühungen sind im Gange, um ihre Lebensräume zu schützen und Bedrohungen zu steuern.