Wisconsin hat mehrere Arten verloren, darunter:
- Östlicher Hellbender (_Cryptobranchus alleganiensis alleganiensis_): Ein Salamander, der aufgrund von Habitatverlust und Verschmutzung nun als ausgerottet gilt.
- Wandertaube (_Ectopistes migratorius_): Einst in Wisconsin häufig, in den späten 1800er Jahren durch Überjagd und Habitatverlust ausgerottet.
- Großer Alk (_Pinguinus impennis_): Ein flugunfähiger Tauchvogel, der in den mittleren 1800er Jahren wegen Federn und Fleisch bis zur Ausrottung gejagt wurde.
- Eskimo-Brachvogel (_Numenius borealis_): Ein Strandläufer, der in den späten 1800er Jahren bis zur Ausrottung gejagt wurde.
- Carolina-Sittich (_Conuropsis carolinensis_): Ein bunter Vogel, der in den frühen 1900er Jahren bis zur Ausrottung gejagt wurde.
- Östlicher Puma (_Puma concolor couguar_): In den frühen 1900er Jahren ausgerottet aufgrund von Jagd und Habitatverlust.
- Wald-Moschusochse (_Symbos cavifrons_): Eine Megafauna-Art des Pleistozäns, ausgestorben vor etwa 10.000 Jahren.
- Pleistozän-Bison (_Bison antiquus_): Der größte bekannte Bison, ausgestorben vor etwa 10.000 Jahren.
- Mastodon (_Mammut americanum_): Ein ikonisches Säugetier der Eiszeit, ausgestorben vor etwa 10.000 Jahren.
- Wollhaarmammut (_Mammuthus primigenius_): Eine Art der Eiszeit, ausgestorben vor etwa 10.000 Jahren.