Innerhalb der Familie Mephitidae ist das gefleckte Stinktier am eng mit dem östlichen Stinktier in den östlichen Spotten verbunden (*Spilogale putorius*) und der westlich gedeckte Stinktier (*Spilogale gracilis*).
Hier ist eine Aufschlüsselung seiner Verwandtschaft:
* Familie: Mephitidae (Skunks)
* Gattung: * Spilogale* (Spotted Skunks)
* Spezies: * Spilogale Putorius* (Spotted Skunk)
Um Ihre Frage zu beantworten, ist das gefleckte Stinktier am engsten mit anderen Spotted -Stinkten und im weiteren Sinne mit allen Stinkten verbunden.