Es ist schwierig, die genaue Anzahl der noch weltweit lebenden Margays zu bestimmen, da sie scheu sind und in abgelegenen Gebieten leben. Laut der Internationalen Union für Naturschutz (IUCN) wird die Margay als „gefährdet“ eingestuft, aufgrund von Lebensraumverlust und Bejagung.
Die Margay-Population wird als rückläufig eingeschätzt, und es wird angenommen, dass es weniger als 10.000 ausgewachsene Individuen in freier Wildbahn geben könnte.