Filoviren sind fadenförmige, umhüllte, nicht-segmentierte, einsträngige, negativ-sinnige RNA-Viren. Unter einem Elektronenmikroskop erscheinen sie als lange, schlanke, fadenförmige Partikel mit einem helikalen Nukleokapsid, umgeben von einer Proteinmatrix und einer äußeren Hülle mit Glykoprotein-Spikes. Diese Spikes binden an Oberflächenrezeptoren von Zellen, um in Wirtszellen einzudringen. Filoviren sind 80 bis 1400 nm lang und 80 bis 100 nm im Durchmesser.