Die Philippinen beherbergen eine Vielzahl einheimischer Süßwasserfische, darunter mehrere Barbenarten. Regenbogenforellen wurden auch zu kommerziellen und Erholungszwecken eingeführt.
Einheimische Arten umfassen
- Gefleckte Barbe (_Puntius binotatus_): Vorkommen in Flüssen, Bächen und Bergseen.
- Einheimische Barbe (_Puntius sp._): Lokal als "dalag" bekannt, kommt in Bergbächen vor.
- Mindoro Barbe (_Puntius sealei_): Endemisch auf der Insel Mindoro.
- Palawan Barbe (_Puntius palata_): Vorkommen in Flüssen und Bächen auf Palawan.
- Malabar Red Barb (_Puntius filamentosus_): Eingeführt und in Gewässern vorhanden.
- Redtail Bristle Barb (_Puntius erythromicron_): Heimisch in philippinischen Flüssen und Bächen.
Weitere einheimische Süßwasserarten sind Goldgurami, Gefleckter Messerfisch, Riesen-Gurami und wilde Skalarpopulationen.