Hammerhaie sind bedroht durch Überfischung für Fleisch, Flossen und Öl sowie Beifang. Die Zerstörung von Korallenriffen und Mangroven entfernt Schutz- und Brutgebiete. Ihre langsame Fortpflanzungsrate – sie bringen alle zwei bis drei Jahre wenige Junge zur Welt – macht eine Erholung der Populationen schwierig.