Proteine werden durch Proteinsynthese hergestellt, die die Transkription genetischer Information von DNA zu RNA und die anschließende Translation von RNA in ein Protein umfasst. Dieser Prozess ist im Wesentlichen bei allen Organismen gleich, einschließlich Fischen und Menschen.
Es kann jedoch Unterschiede in den spezifischen Proteinen geben, die von verschiedenen Arten produziert werden, sowie in der Regulation der Proteinsynthese. Zum Beispiel können einige Proteine in unterschiedlichen Mengen oder zu unterschiedlichen Zeiten exprimiert werden. Zudem können einige Organismen einzigartige Proteine haben, die in anderen nicht vorkommen.