Flussotter-Populationen sind zurückgegangen aufgrund von Jagd und Fallenstellung wegen des Fells, Lebensraumzerstörung durch Urbanisierung und Umweltverschmutzung, Empfindlichkeit gegenüber Ölverschmutzung, Pestizidkontamination und Klimawandel, der aquatische Ökosysteme beeinträchtigt.