Es gibt nur eine Art des Flusspferdes: Hippopotamus amphibius, allgemein bekannt als gewöhnliches Flusspferd oder einfach Flusspferd.
Es gibt jedoch zwei Unterarten:
* Hippopotamus amphibius amphibius: In den meisten Teilen des Verbreitungsgebiets des Flusspferdes in Afrika südlich der Sahara zu finden.
* Hippopotamus amphibius kiboko: Hauptsächlich in Westafrika zu finden.
Es gibt auch das Zwergflusspferd (Choeropsis liberiensis), das eine völlig separate Art ist und viel kleiner. Sie kommen in den Wäldern Liberias und Sierra Leones vor.
Also, während es verschiedene Populationen und Unterarten gibt, gibt es nur eine wahre Art des Flusspferdes: Hippopotamus amphibius.