Die geschätzte Population der Bergzwergopossums in freier Wildbahn liegt bei etwa 1.500 bis 2.000 Individuen. Ihre Population ist stark fragmentiert, und ihr Lebensraum ist eingeschränkt, was sie zu einer kritisch gefährdeten Art macht. Derzeit laufen Schutzbemühungen, um ihren Lebensraum zu schützen und ihre Zahl zu erhöhen.