Kojoten sind Spitzenprädatoren mit sehr wenigen natürlichen Feinden, aber einige Tiere jagen sie:
- Größere Hundeartige: Wölfe, besonders dort, wo sich die Verbreitungsgebiete überschneiden
- Bären: Schwarzbären und Grizzlybären
- Berglöwen: Stark genug, um erwachsene Kojoten zu erlegen
- Menschen: Durch Jagd, Fallenstellung und Straßenverkehr
- Andere Kojoten: Artenspezifische Prädation während Nahrungsknappheit oder Revierkonkurrenz
Spezifische Feinde variieren je nach Standort und Umweltfaktoren.