1. Lebensraumverlust
Der bedeutendste Faktor für die Gefährdung des Mexikanischen Wolfs ist der Lebensraumverlust. Dies ist hauptsächlich auf die Umwandlung natürlicher Lebensräume in landwirtschaftliche und urbane Gebiete zurückzuführen. Infolgedessen haben Mexikanische Wölfe den Zugang zu ihrer natürlichen Beutebasis und geeigneten Wurfstätten verloren.
2. Bejagung und Fallenstellung
Historisch gesehen wurden Mexikanische Wölfe wegen ihres Fells und als Mittel der Raubtierkontrolle gejagt und gefangen. Diese wahllose Tötung von Wölfen reduzierte ihre Populationen weiter.
3. Hybridisierung
Mexikanische Wölfe sind eng mit Kojoten verwandt, und Kreuzungen zwischen den beiden Arten wurden dokumentiert. Hybridisierung kann zur Verwässerung der genetischen Integrität des Mexikanischen Wolfs und zum Verlust einzigartiger Anpassungen führen, die für das Überleben in ihrer natürlichen Umgebung unerlässlich sind.