Ja, Black Doom überlebt die Ereignisse von Shadow the Hedgehog.
Am Ende des Spiels wird Black Doom besiegt und in den Black Comet geworfen, der dann zerstört wird. Trotz dieses scheinbaren Endes wird später enthüllt, dass Black Doom überlebt hat und Rache an Shadow und der Welt plant.
Black Doom kehrt als Hauptantagonist in Sonic the Hedgehog (2006) zurück, wo er eine Invasion der menschlichen Welt anführt und versucht, die Eclipse Cannon mit den Chaos Emeralds mit Energie zu versorgen. Shadow und seine Verbündeten stoppen die Waffe, aber Black Doom entkommt erneut.
Sein letztes Schicksal bleibt unbekannt. Während viele glauben, dass er umkam, als der Black Comet zerstört wurde, könnte er überlebt haben und in einer zukünftigen Ausgabe zurückkehren.