Die Rote Liste der IUCN stuft die Geisterfledermaus (Macroderma gigas) als „potenziell gefährdet“ ein, nicht als „gefährdet“. Die Art weist jedoch mehrere Schwachstellen auf:
1. Lebensraumverlust: Bergbau, Entwaldung und Höhlenstörungen degradieren ihre Schlafplätze.
2. Jagd und Verfolgung: Historische und laufende Jagd wegen Nahrung, Dekoration oder als wahrgenommene Nutztierbedrohung.
3. Eingeschränktes Verbreitungsgebiet und Population: Beschränkt auf Nordaustralien mit einer relativ kleinen Population.
4. Klimawandel: Temperatur- und Luftfeuchtigkeitsänderungen beeinflussen Schlafplätze und Insektenbeute.
5. Verringerte Fortpflanzungsrate: Weibchen bringen normalerweise alle zwei Jahre ein Jungtier zur Welt, was die Populationserholung verlangsamt.