Papageitaucher sind sowohl in der Luft als auch im Meer Fressfeinden ausgesetzt.
Luftfeinde
Wanderfalken und Merlinjagdfalken jagen Papageitaucher, besonders während der Brutzeit. Auch Raubmöwen, Skuas, Eissturmvögel und Silbermöwen erbeuten sie.
Meerestiere
Kegelrobben, Seehunde, Schwertwale und Tümmler können Papageitaucher jagen, während diese nach Fischen tauchen.