Totenkopfaffen verändern ihre Umwelt nicht aktiv wie Menschen, aber sie beeinflussen ihren Regenwald-Lebensraum:
* Samenverbreitung: Durch Kot nach Fruchtverzehr.
* Baumschäden: Futtersuche kann Bäume beschädigen.
* Konkurrenz: Sie konkurrieren mit anderen Arten um Nahrung.
Diese Effekte sind kleinräumig. Menschliche Aktivitäten (Abholzung) haben weitaus größere zerstörerische Auswirkungen.